Bio-Informaticien Expert H/F - 49

L'Institut de Cancérologie de l'Ouest (ICO) est un Centre de Lutte contre le Cancer, établissement de santé privé d'intérêt collectif qui a une quadruple vocation : la Prévention, le Soin, la Recherche et l'Enseignement.

Pour sa Plateforme de Génétique moléculaire au sein du Département de Biologie Médicale et Biologie des essais cliniques du site angevin, l'ICO recherche un bio-informaticien expérimenté pour renforcer son équipe de 2 bio-informaticiens. Le bio-informaticien est chargé de la mise en place, du maintien et de l'amélioration des workflows d'analyse bioinformatique provenant des séquenceurs à haut débit (NGS) à visée diagnostique et recherche, et de l'analyse des données de génomique (panels ciblés, WES, WGS, WTS). Il participe à l'accréditation ISO15189 des applications bioinformatiques.ACTIVITES

Bioinformatique

- Mise en place, supervision et exécution des workflows d'analyses bioinformatiques basés sur les technologies de biologie moléculaire et de NGS présentes sur la Plateforme de Génétique Moléculaire.
- Analyse des données de génomique constitutionnelle et somatique produites sur la plateforme de l'ICO : panels ciblés (ADN et ARN), exome (WES), génome (WGS), transcriptome (WTS), signatures mutationnelles, CNV...
- Mise en forme des résultats (visualisation des données).
- Formation des utilisateurs finaux.
- Participation aux évolutions techniques et applicatives des workflows mis en place, veille scientifique

Qualité

- Mise en place et maintien de l'accréditation ISO15189 du NGS pour la composante informatique en relation avec le responsable de l'accréditation.
- Participation au système de management de la qualité via l'extraction de données du logiciel de gestion de laboratoire (activité, facturation, délais, non-conformités ...).

Projets

- Participation aux projets transversaux de la Plateforme de Génétique Moléculaire.

Autres

- Participation à la valorisation scientifique de la Plateforme de Génétique Moléculaire.
- Participation à l'encadrement de stagiaires de la Plateforme de Génétique Moléculaire (M1, M2).